Default setup overrides existing CodeQL setups by disabling any existing CodeQL workflows, and blocking any CodeQL analysis API uploads. This behavior stops you using GitHub Actions minutes to run workflows for CodeQL advanced setup when only the results from default setup will be used. For more information about switching between advanced and default setups, see Results are different than expected.
Optionally, if you are certain you no longer need the pre-existing workflow file, you can delete the file from your repository. For more information, see Excluir arquivos em um repositório.
Em alguns casos, seu repositório pode usar várias configurações do code scanning. Essas configurações podem gerar alertas duplicados. Além disso, as configurações obsoletas que não forem mais executadas exibirão status de alerta desatualizado e os alertas obsoletos permanecerão abertos indefinidamente. Para evitar alertas desatualizados, você deverá remover configurações obsoletas do code scanning de um branch. Para obter mais informações sobre várias configurações e excluir configurações obsoletas, confira Sobre alertas de digitalização de códigos e Resolvendo alertas de varredura de código.